思政课教师和辅导员是高校思想政治教育的两支重要队伍，是对学生进行思想政治教育的中坚力量，其角色定位存在差异，工作内容也各有侧重，但都发挥着不可替代的作用。随着新媒体的普及和人工智能的飞速发展，医学生的思想价值观念受到多元化网络思想的冲击，医学院校的思想政治教育面临全新的机遇和挑战。因此，在新媒体背景下将思政课教师和辅导员两支队伍融合，形成医学院校思想政治教育的育人合力，显得尤为重要。文章采用文献研究法、案例分析法、问卷调查法等方法，通过查阅相关文献资料和调查网上网下医学院校实际情况，分析新媒体背景下医学院校思政课教师与辅导员协同育人的现实价值及困境，并探索两支队伍协同育人的创新路径。建议通过强化理论学习、拓宽沟通渠道、搭建合作平台、创新协同方式等路径融合两支队伍的工作，以充分调动二者的积极性，使双方在思想政治教育工作中做到共担责任、双向融合、取长补短、互通信息，从而形成育人合力，构筑立体化的育人体系，有效提升大学生的思想政治素质。