不同土地利用方式对农田生态系统的结构和功能产生了重要影响，但对产生氧化亚氮的关键基因——亚硝酸盐还原基因丰度的区域分布特征的影响尚不清楚。本研究选取江西省16个县市种植花生的旱地土和水稻土，使用实时荧光定量PCR方法测定两种土地利用方式下酸性农田土壤亚硝酸盐还原基因nirS和nirK丰度。结果表明：种植花生的旱地土硝态氮和速效磷含量显著高于水稻土，总碳、总氮和铵态氮含量显著低于水稻土，pH值和可溶性有机碳含量与水稻土无显著差异。旱地土和水稻土的nirS基因丰度均比nirK丰度高出100倍以上，表明nirS型亚硝酸盐还原微生物在酸性农田土壤中占主导。此外，旱地土的nirS和nirK基因丰度显著高于水稻土，表明旱地土可能更有利于亚硝酸盐还原微生物生长。总氮含量是预测旱地土nirS和nirK基因丰度最主要的环境因子，而铵态氮含量对水稻土nirS和nirK基因丰度的解释度最高。综上，江西省酸性农田土壤亚硝酸盐还原基因丰度主要受土壤氮素形态和水平调控。