清理和降低涉企收费是地方政府落实降费减负政策、深化“放管服”改革的关键举措。文章基于2008—2022年A股上市企业数据，实证检验涉企收费降费减负对企业双元创新投资的影响。研究结果表明：涉企收费降费减负对企业双元创新投资呈现差异化影响，具体表现为对探索式创新投资具有显著促进效应，而对开发式创新投资不存在显著影响。作用机制检验表明，涉企收费降费减负主要通过缓解融资约束、优化营商环境促进探索式创新投资。进一步研究发现，地方政府效率提升会强化涉企收费降费减负对探索式创新投资的促进效应；相对于东部地区企业，该政策对探索式创新投资的促进效应在中西部地区企业更为显著。研究扩展了降费减负政策的财务效应和企业双元创新影响因素的相关文献，为政策制定者完善涉企收费政策改革和企业创新投资结构优化提供了经验证据。