为明确不同轮作模式对马铃薯根际土壤细菌群落的影响，本研究以马铃薯-小麦-甜菜-马铃薯(A处理)、马铃薯-水飞蓟-小麦-马铃薯(B处理)、小麦-甜菜-小麦-马铃薯(C处理),油菜-小麦-甜菜-马铃薯(D处理),小麦-油菜-大麦-马铃薯(E处理)和油菜-小麦-马铃薯-马铃薯(CK,对照)6种种植模式为研究对象，采用细菌16S区的高通量测序技术，对比分析当地6种种植模式对马铃薯根际土壤细菌群落结构和功能的影响。结果表明，6种轮作模式的土壤样本共获得36 420个扩增子序列变异(ASV),划分为45门、119纲、298目、451科、790属和357种。不同轮作模式马铃薯根际土壤主要优势菌群同为变形菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、芽单胞菌门、放线菌门、浮霉菌门、疣微菌门、绿弯菌门、黏球菌门、髌骨菌门，但主要优势菌群的相对丰度在不同轮作模式中存在差异。与CK相比，轮作明显提高了细菌中酸杆菌门和芽单胞菌门细菌的相对丰度，而放线菌门细菌相对丰度明显降低，溶杆菌属细菌以及与碳、氮相关的功能菌相对丰度升高。组间群落差异分析(LEfSe)结果表明，在细菌群落中共鉴定出38个差异物种。通过基因功能预测发现，一级功能中新陈代谢的相对丰度最大(62.04%～62.46%),相对丰度大于1.0%的二级功能代谢通路有19类，其中碳水化合物代谢的相对丰度最高(12.93%～13.29%)。综上所述，轮作改变了土壤细菌群落结构，提高了土壤细菌中的优势功能菌，其中以小麦-甜菜-小麦-马铃薯轮作模式效果最好，更适宜高寒黑土区马铃薯产业的可持续发展。