昆虫病原线虫共生菌是一类重要的生物防治资源。为明确本单位分离自小卷蛾斯氏线虫共生菌YZ011对鳞翅目害虫的杀虫活性及机制，本研究在测定菌株YZ011对小菜蛾和草地贪夜蛾血腔注射毒性的基础上，进一步对其进行全基因组测序和比较基因组学分析。结果表明，血腔注射100 nL 1.0×10~6 CFU/mL菌株YZ011 24 h后，小菜蛾幼虫和草地贪夜蛾幼虫的死亡率分别为75.0%和56.7%,均显著高于血腔注射磷酸盐缓冲液(PBS)对照。全基因组测序结果显示菌株YZ011为嗜线虫致病杆菌，其基因组含有19个次级代谢产物基因簇；与其同源性最高的嗜线虫致病杆菌菌株YL001和菌株SⅡ相比，菌株YZ011含有29个特异基因簇。菌株YZ011基因组中共注释到586个毒力因子相关基因。本研究结果从基因组层面解析了嗜线虫致病杆菌YZ011的分子特征，对菌株YZ011的综合利用具有重要意义。