家蚕是以桑为食、吐丝结茧的经济性昆虫,在国民经济发展中作了重要贡献。春季气候适宜,叶质优,茧质良,容易取得蚕茧高产,是一年中最佳的养蚕期。因此,养好春蚕是增加蚕农收益的关键。蚕种是蚕业生产中的重要环节,春用蚕种分为秋制春用越年种(Autumn-produced eggs for next spring rearing,AS)和春制春用越年种(Spring-produced eggs for next spring rearing,SS)两种类型,均采用复式冷藏的方法进行蚕种保护。大多数生产品种的秋制春用和春制春用越年种的孵化率无显著性差异。然而,生产品种秋丰A的两种类型越年种均能转青但是孵化率却存在显著差异。由于秋丰A的秋制春用和春制春用越年种出库时间一致且都能发育到转青期,我们选择这两个时间点对其进行转录组测序分析。结果显示出库和转青期的差异基因KEGG分析发现主要富集于能量代谢通路,尤其能量调控相关的PPAR通路。可能是两种类型的越年卵储存时间差异使能量消耗,最终导致孵化率不同。本研究结果揭示家蚕不同保护时长越年种在能量代谢方面的差异,为蚕种生产的孵化率稳定提供理论基础,对蚕业良性发展也极具指导意义。